Estructura de las proteínas. Tomada de Wikipedia

La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos de la proteína. Por tanto, nos indica qué aminoácidos componen la cadena polipeptídica y el orden en que dichos aminoácidos se encuentran. Es de gran importancia, ya que de ella dependen los demás niveles estructurales. La función de una proteína depende de su secuencia de aminoácidos y de la forma que ésta adopte.

Todas las proteínas presentan un extremo N-terminal, en el que se encuentra el primer aminoácido con su grupo amino libre, y un extremo C-terminal, en el que está situado el último aminoácido con su grupo carboxilo libre. La secuencia de una proteína se escribe enumerando los aminoácidos desde el extremo N-terminal hasta el extremo C-terminal.

La secuencia de aminoácidos es única para cada proteína, pues la información necesaria para construirla se encuentra codificada en el ADN. 

La alteración de la estructura primaria por eliminación, adición o intercambio de algún aminoácido da lugar a una proteína distinta, que puede realizar una función diferente o incluso perder su actividad biológica.

La estructura primaria es mantenida por el enlace peptídico, tan estable que sólo se puede romper por hidrólisis ácida o enzimática, lo que implica la destrucción de la proteína y la liberación de los aminoácidos que la integran.